【矿产资源】  南阳市矿产资源丰富，是矿产资源大市，资源种类繁多，储量分布相对集中，区位优势明显，有利于规模化开发和形成产业优势。至2022年底，全市发现矿种85种，开发利用矿种46种，发现矿产地446处。能源矿产石油资源储量位居全省第二，地热资源潜力较大；金属矿产金、银矿资源储量位居全省前列，除内乡县的铜多金属、淅川县钒矿、唐河县铜镍矿为大型矿床，其他多数为中小型矿床；非金属矿产以天然碱、石墨、萤石、“高铝三石”（蓝晶石、红柱石、矽线石）、水泥用灰岩、花岗岩、大理岩、橄榄岩、白云岩为优势矿产；水气矿产矿泉水资源较丰富。                            

【农业资源】 南阳市素有“中州粮仓”之称。粮食作物主要有小麦、玉米、红薯、大豆、水稻等；经济作物主要有棉花、花生、芝麻、油菜、烟叶、蔬菜、水果、食用菌、茶叶、中药材等。2022年，全市粮食作物种植面积为1308.3千公顷,比上年增长 0.1% 。其中，夏粮种植面积729.21千公顷，增长0.02%；秋粮种植面积577.59千公顷，增长0.23%。小麦种植面积728.37千公顷，增长0.03%；玉米种植面积467.86千公顷，增长0.53%；棉花种植面积0.4951千公顷，增长280.8%；油料种植面积390.03千公顷，下降1.69%；蔬菜种植面积255.48千公顷，增长1%。全年粮食产量715.55万吨，比上年增长0.31%。其中，夏粮产量433.66万吨，增长0.49%；秋粮产量281.85万吨，增长0.03%。小麦产量433.50万吨，增长0.49%；玉米产量231.689万吨，增长5.1%。全年棉花产量0.06万吨，增长287.8%。油料产量172.68万吨，下降2.64%。蔬菜产量1195.46万吨，增长1.8%。水果产量130.83万吨，增长7.87%。食用菌产量30.39万吨，增长3.51%。

【动植物资源】  2022年，南阳市境发现有陆生脊椎动物345种。其中哺乳类29种，鸟类286种，爬行类19种，两栖类11种。还有节肢动物、环节动物、线形动物、扁形动物、腔肠动物、原生动物等。饲养动物主要有牛、马、驴、骡、猪、羊、兔、狗、猫、鸡、鸭、鹅、鹿、貂、蜂等。“南阳牛”体型高大，肌肉发达，皮质优良，为五大地方优良品种之一。“南阳黑猪”在全省享有盛名。南阳柞蚕养殖居全省首位，柞绸驰名中外。全市有维管束植物186科921属2733种，其中蕨类植物27科64属163种，裸子植物6科14属20种，被子植物153科843属2550种。记录到国家重点保护野生植物50余种，主要有秦岭冷杉、红豆杉、香果树、银杏、水曲柳等。列入省级重点保护的植物共47余种，主要有铁杉、石槲、辛夷等。西峡县猕猴桃，南召县辛夷居全国之首。

【水利资源】 南阳市是河南省河网比较密集的地区之一。众多河流分属长江、淮河、黄河三大水系。长江水系汉水流域的唐河、白河水系最大，支流较多，水资源丰富；丹江水系次之。淮河水系分布在南召县、方城县、桐柏县3县。黄河水系只有南召县马市坪乡汇入嵩县的伊洛河（流域面积24平方千米）。2022年，全市流域面积50平方千米以上河道184条，100平方千米以上99条，1000平方千米以上14条，1万平方千米以上3条。水资源总量36.231亿立方米，地下水资源（不重复量）7.1844亿立方米。可利用水资源总量32.6亿立方米。总用水量25.7149亿立方米。其中，农业用水16.1294亿立方米，工业用水2.083亿立方米，生活用水4.1449亿立方米，人工生态环境补水3.3576亿立方米。在地表水开发方面，有大型水库2座，中型水库26座，小型水库489座，总库容25.35亿立方米。水利工程供水能力达到48.3亿立方米。

【林业资源】 南阳市是林业大市。2022年，全市林业用地面积121.47万公顷（不含邓州市），其中森林面积96.07万公顷，森林覆盖率40.51％，森林蓄积量4083万立方米。中国伏牛山世界地质公园，面积5858.52平方千米。国家和省级自然保护区8个（南阳恐龙蛋化石群国家级自然保护区、河南伏牛山国家级自然保护区、河南桐柏高乐山国家级自然保护区、河南宝天曼国家级自然保护区、河南丹江湿地国家级自然保护区、河南桐柏太白顶省级自然保护区、河南内乡湍河湿地省级自然保护区、西峡大鲵省级自然保护区)，面积2322平方千米。国家和省级森林公园15个(西峡县寺山和桐柏县淮源国家级森林公园，淅川县上寺、淅川县凤凰山、淅川县猴山、镇平县菩提寺、南召县丹霞寺、南召县猿人山、南阳市独山、南阳市兰湖、社旗县霸王山、方城县大寺、七峰山、唐河石柱山和宛城省级森林公园)，面积304平方千米。